本公开公开了基于CNN的心电信号处理方法及心律不齐检测系统，包括：对心电信号进行预处理得到总样本集；构建卷积神经网络；采用十折交叉检验方式，对总样本集分十次划分成训练集和测试集；利用每一次划分的训练集对卷积神经网络进行训练；然后利用每一次训练集所对应的测试集对卷积神经网络进行测试，获得模型的分类精度；将十次分类精度进行加和求平均值，将平均值与设定阈值进行比较，如果分类精度平均值大于等于设定阈值，则停止训练，得到训练好的卷积神经网络；对待识别的心电信号进行预处理，将连续的心电信号分离成单个心跳信号，将待识别的单个心跳信号依次输入训练好的卷积神经网络中，卷积神经网络输出对待识别信号的分类结果。