本发明涉及一种空间变换用标记块及其视觉定位配准方法，它可减小人员操作误差，提高配准精度，兼容各种成像设备，降低标记块和定位成本。结构为：盖板安装在底座上，盖板上设有视觉标记，底座内设有N形标记块；底座安装在托板上，N形标记块内填充成像物质。(1)由透视成像设备对标记块进行成像处理，获得图像体数据；对N形标记块的中点在体数据图像中进行定位并将该中点坐标作为标记点的体数据空间坐标；(2)利用立体视觉定位系统对视觉标记进行自动识别、定位，计算N形标记块中点的坐标，作为标记点的视觉空间坐标；(3)利用仿射法或SVD法，计算体数据图像空间与视觉空间的空间变换阵，完成体数据空间与视觉空间的配准。