本发明公开了一种Zn-Zr中间合金，其特征是由以下质量百分比的组分组成：锆0.01-17wt.%，其余为锌。本发明还公开了其制备方法和应用，本发明制备过程简单，无污染，为环境友好型生产工艺，所得中间合金对亚共晶和过共晶锌-铝合金中的初生η-Zn或初生α-Al具有高效的晶粒细化作用，且中间合金有较低的熔化温度，从而保证了进行晶粒细化时中间合金加入到锌-铝合金中后能够迅速熔化并均匀分布，降低了锌-铝合金熔炼温度、减少熔炼、处理时间，大大降低了生产成本。