本发明涉及一种复合发芽蛋白营养粉及其制备方法，属于食品加工领域。本发明的复合发芽蛋白营养粉是将黄豆芽与花生芽于95-100℃蒸制30-50min后于60℃下鼓风干燥，然后在20～25℃下粉碎成粒度为80～120目的黄豆芽粗粉与花生芽粗粉；再将黄豆芽粗粉与花生芽粗粉混合后粉碎成400目以上的细粉。本发明首次将黄豆芽和花生芽制备成粉状产品；提高了黄豆与花生的生物利用率和加工深度；将其可食用部分的利用率提高到95%以上。本发明采用蒸制手段进行熟化，有效防止黄豆芽和花生芽的褐变及其中有效成分的流失。本发明的蛋白营养粉具有黄豆与花生特有的香味和风味，色泽鲜美，口感细滑，油脂含量低，贮藏期长。