本发明公开了一种一体化脱氮除磷曝气生物滤池净水系统及净水方法。一体化脱氮除磷曝气生物滤池净水系统的立式沉淀池位于方型曝气生物滤池内部，立式沉淀池与方型曝气生物滤池通过溢流的形式相连接，曝气生物滤池底部接有曝气装置，原水进水管上设有加药装置。本发明的净水方法，包括如下步骤：(1)原水在静态混合器与混凝剂混合；(2)絮凝；(3)化学沉淀除磷；(4)物理过滤、截留；(5)好氧生物处理去除有机物和脱氮；(6)出净水。本发明的净水系统其沉淀部分、曝气生物滤池部分构成一体，而处理过程又相互独立，水处理中各个阶段互不影响，并且在化学沉淀、物理过滤以及生物氧化的相互作用下，各阶段能达到预定的处理效果，出水水质稳定。