本发明提供一种基于降维窗口的主成分分析方法及系统，包括如下步骤：1.输入待处理数据集X；S2.初始化降维窗口参数e和结束条件参数a；3.根据输入数据集X计算得到初始相关系数矩阵B；4.根据初始相关系数矩阵B计算得到相关系数矩阵P；5.根据相关系数矩阵P判断是否符合结束条件；若是，进入步骤6；若否，进入步骤7；6.输出降维结果数据集X`；7.为相关系数矩阵P添加降维窗口，并将相关系数矩阵P每行元素按大小排列；8.判断是否出现窗口溢出，或者，出现窗口宽度优化后无变化；若是，进入步骤9；若否，进入步骤10；9.优化降维窗口参数；返回步骤7；10.在降维窗口内对数据进行降维处理；返回步骤3。
