本发明公开了一种基于矩阵转化的掌纹识别方法,首先随机产生一个广义置换矩阵,接着通过广义置换矩阵变换产生两个基本置换矩阵,然后对两个基本置换矩阵进行异或产生不可逆置换矩阵,使用此不可逆置换矩阵将原始掌纹图像的二值特征矩阵进行转化生成安全的掌纹特征代表矩阵;识别时同样利用不可逆置换矩阵产生待识别掌纹图像的掌纹特征代表矩阵,同时提供广义置换矩阵,利用距离匹配算法或者使用SVM分类器将待认证的掌纹特征代表矩阵与原始掌纹图像的掌纹特征代表矩阵进行认证决策。本发明能对掌纹生物特征的安全性和隐私性进行有效的保护,既能够提高掌纹识别的安全性,又能够提高掌纹识别的识别准确性以及计算识别效率或者速度。