本发明公开了一种格室基质填充的虹吸式垂直流人工湿地,包括池体,所述池体为顶部敞口的槽状结构;所述池体通过无孔隔板分隔形成跌水滤池和格室,无孔隔板下端与池体底部不连接,所述跌水滤池和格室在底部相连通;在格室内至少安装一个有孔隔板,有孔隔板将格室分隔成距离跌水滤池由近及远的至少两个基质滤室;在跌水滤池顶端安装散水管;在距离跌水滤池最远的基质滤室底部安装出水管路;在跌水滤池和各个基质滤室的底部均填充基础层;在跌水滤池基础层的上方填充过滤层,在各个基质滤室基础层上方依次填充发生层、阻隔层和种植层。既保证了污水处理效果,又解决了人工湿地频繁堵塞的问题,且堵塞后方便清理。