本发明涉及一种处理不含钙离子强碱性废水的复合微生物絮凝剂及其应用,属于工业废水生物处理领域。将微生物絮凝剂和氯化钙溶液混合,制备得到复合微生物絮凝剂;所述微生物絮凝剂是在一定条件下将节杆菌(Arthrobacter?sp)接种于培养基培养、发酵,将发酵培养液离心,所得胞外上清液即为微生物絮凝剂。通过将以上微生物絮凝剂和氯化钙溶液配合使用,实现互补,避免了单一微生物絮凝剂在不含钙离子强碱性废水中使用效果一般的问题,显著提高絮凝效率,显著降低废水的pH。本发明的复合微生物絮凝剂使用简单,絮凝效率高,絮凝剂投加量低,生产成本低。