本发明公开了一种应用于河道的涡轮式防淤回灌系统,包括回灌池和回灌井,所述的回灌池内设置有反滤料,所述的回灌池设置于河道护坡,所述的回灌井设置于坡顶的下方,所述的回灌池通过回灌管道与所述的回灌井相连通,所述的回灌管道上设置有阀门。所述回灌池的上方设置有透水盖板。所述的回灌池内设置有集水槽,所述的集水槽上转动设置有一驱动轴。所述驱动轴的下端设置有驱动涡轮,所述驱动轴的上端延伸至所述回灌池的外部,所述驱动轴的顶端铰接有扰动杆。所述的集水槽上位于所述驱动涡轮的上方设置有漏水孔。该回灌系统不仅能够有效的防淤,防止反滤料被冲走,而且在水质污染时可以关闭应急阀门,防止被污染的水回灌至地下水含水层。