本发明公开了一种基于分子动力学模拟探究玻璃体系中各原子扩散性质的方法，包括以下步骤：构建无定形玻璃的盒子模型；对玻璃盒子模型进行几何优化；对几何优化后的玻璃盒子模型进行分子动力学计算，包括1)高温弛豫，2)高温下连续降温至低温，3)低温弛豫；输出不同温度下的构象轨迹文件；对不同温度下输出的构象轨迹文件进行统计分析，输出不同原子的均方位移分布；根据爱因斯坦定律求出不同原子的扩散系数。本发明采用分子动力学方法对不同温度下玻璃结构的统计分析，结合爱因斯坦定律，解决了实验手段不能测试和分析玻璃在不同温度下原子的扩散系数的问题，有助于更加准确的认识玻璃形成过程中原子的扩散行为，为分析和探究玻璃的微观结构提供了参考。
