本公开提供了一种考虑谐波的计及分布式电源的配电网网损分摊方法及系统。其中，该方法，包括获取配电网拓扑结构及配电网中各负荷节点的功率及分布式电源的功率，并对计及分布式电源的配电网进行网损计算，得到配电网总网损；计算出谐波网损分配因子；根据计算出的谐波网损分配因子，将配电网总网损分成谐波总网损和基波总网损这两部分；根据配电网拓扑结构以及配电网中各个节点的有功功率，利用平均网损分摊法将基波总网损分配给各个节点；获取各个节点的电流总谐波畸变率，得到各个节点的谐波畸变因子，根据各个节点的谐波畸变因子将谐波总网损分配给各个节点；分别将各个节点分配得到的基波网损和谐波网损对应相加，得到各个节点分配的总网损。